中性蛋白酶和木瓜蛋白酶都是食品及饲料领域重要的加工助剂，两者主要在来源、性质、作用机制、应用场景等方面存在区别。

酶系来源：木瓜蛋白酶主要来源于木瓜的未成熟果实，通过割取的浆汁，这些浆汁中含有丰富的木瓜蛋白酶。通过收集乳胶，并采用适当的提取和纯化方法，可以得到高纯度的木瓜蛋白酶。从乳胶中提取木瓜蛋白酶是目前工业生产中常用的方法之一。中性蛋白酶主要由微生物发酵产生，主要由枯草芽孢杆菌提取，这些细菌在生长代谢过程中会分泌中性蛋白酶到细胞外，以分解环境中的蛋白质，获取氮源等营养物质。工业上常利用这些细菌进行大规模发酵生产中性蛋白酶。

最适反应条件：木瓜蛋白酶的适宜 pH 值范围较广，在 pH 值 4.0 - 9.0 之间都有较好的活性，尤其在偏酸性环境中仍能保持较高活性，最适作用温度通常在 55 - 65℃。中性蛋白酶在中性 pH 值（6.0 - 7.5）条件下活性较高且稳定，但在酸性或碱性环境中活性可能会下降。最适作用温度一般在 40 - 60℃。

上图为中性化血清酶

中性蛋白酶和木瓜蛋白酶应用场景的区别

中性蛋白酶：面粉减筋，生产酥性饼干；小麦蛋白改性及水解，生产小麦蛋白肽；啤酒的澄清，防止冷浑浊；在制革工业中，用于皮革的脱毛和软化；加入饲料中，做为外源酶补充，提高动物吸收消化率；

木瓜蛋白酶：在保健食品包装机械化的中，经常使用于肉产品的嫩化、也可种植销售嫩肉粉；纯生红啤酒的消解、加快纯生红啤酒色香味俱全；食品的松疏，种植销售酥性食品等 ；发酵粉抽提物种植销售这个领域，加速率发酵粉破壁速率、是发酵粉抽提物种植销售重点的制造改性剂。

普通球淀粉酶酶酶和木瓜球淀粉酶酶酶的会选定 ，包括会根据中应的各种需求和加工工艺前提前提来会选定 。举例说明，而对于那些还要在偏酸自然环境中实行的球淀粉酶酶质溶解操作过程，木瓜球淀粉酶酶酶也许 是好些的会选定 ；而而对于那些在普通前提前提下实行的工艺种植，普通球淀粉酶酶酶则会比较支持。

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